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■京化■京都大学理学部化学科・京都大学大学院理学研究科学専攻

林 重彦(教授)

専門分野
理論化学、生物物理学
研究テーマ
分子シミュレーションによるタンパク質機能の分子機構の解明



代表的な論文
  1. Molecular mechanism of wide photoabsorption spectral shifts of color variants of human cellular retinol binding protein II. Cheng Cheng, Motoshi Kamiya, Yoshihiro Uchida, Shigehiko Hayashi, Journal of the American Chemical Society, 137, 13362-13370 (2015).
  2. Linear response path following: a molecular dynamics method to simulate global conformational changes of protein upon ligand binding. Koichi Tamura and Shigehiko Hayashi, Journal of Chemical Theory and Computation, 11, 2900-2917 (2015).
  3. Atomistic design of microbial opsin-based blue-shifted optogenetics tools. Hideaki E. Kato, Motoshi Kamiya, Seiya Sugo, Jumpei Ito, Reiya Taniguchi, Ayaka Orito, Kunio Hirata, Ayumu Inutsuka, Akihiro Yamanaka, Andrés D. Maturana, Ryuichiro Ishitani, Yuki Sudo, Shigehiko Hayashi, and Osamu Nureki, Nature Communications, 6, 7177 (2015).
  4. 新しい酵素を理論的にデザインすることはできるのか-存在の耐えられない複雑さ-. 林重彦, 現代化学 2015 年 2 月号, 25-27 (2015).
  5. Quantum Biology of Retinal, Klaus Schulten and Shigehiko Hayashi, Quantum Effects in Biology, Cambridge University Press, Chapt. 11, 237-263 (2014).
  6. ハイブリッド分子シミュレーションと実験研究の接点で見える生体分子機能のメカニズム. 林重彦, 化学フロンティア 23 1 分子ナノバイオ計測-分子から生命システムを探る革新的技術, 化学同人, 第 6 章, 89-98 (2014).
  7. タンパク質の生物学的機能と化学反応. 林重彦, 岩波講座計算科学第 4 巻 計算と生命, 第 3.3 章, 98-112 (2012).
  8. Molecular mechanism of ATP hydrolysis in F1-ATPase revealed by molecular simulations and single molecule observations. Shigehiko Hayashi, Hiroshi Ueno, Abdul Rajjak Shaikh, Myco Umemura, Motoshi Kamiya, Yuko Ito, Mitsunori Ikeguchi, Yoshihito Komoriya, Ryota Iino, and Hiroyuki Noji, Journal of the American Chemical Society, 134, 8447-8454 (2012).
  9. Crucial role of protein flexibility in formation of a stable reaction transition state in an a-amylase catalysis. Takahiro Kosugi and Shigehiko Hayashi, Journal of the American Chemical Society, 134, 7045-7055 (2012).
  10. タンパク質の生物学的機能と化学反応. 林重彦, 岩波講座計算科学第 4 巻 計算と生命, 第 3.3 章, 98-112 (2012).
  11. 酵素反応と生体分子機能の分子シミュレーション. 林重彦, CSJ カレントレヴュー・巨大分子系の計算化学 , 08, 第 17 章, 166-171 (2012).
  12. QM/MM reweighting free energy SCF for geometry optimization on extensive free energy surface of enzymatic reaction. Takahiro Kosugi and Shigehiko Hayashi, Journal of Chemical Theory and Computation, 8, 322-334 (2012).
  13. 分子シミュレーションによる F1-ATPase の構造機能解析. 林重彦, 蛋白質核酸酵素, 52, 3229-334 (2007).
  14. ハイブリッドQM/MM分子シミュレーションによる生体内化学反応と機能の研究.林重彦, 生物物理, 46, 76-81 (2006).
  15. Molecular dynamics simulation of bacteriorhodopsin’s photoisomerization using ab initio forces for the excited chromophore. Shigehiko Hayashi, Emad Tajkhorshid, and Klaus Schulten, Biophysical Journal, 85, 1440-1449 (2003).
  16. Proton transfer in bacteriorhodopsin: structure, excitation, IR spectra, and potential energy surface analyses by an ab initio QM/MM method. Shigehiko Hayashi and Iwao Ohmine, Journal of Physical Chemistry B, 104, 10678-10691 (2000).
略歴
1994-1997 京都大学大学院理学研究科化学専攻博士課程
1997-2001 日本学術振興会特別研究員(京都大学・名古屋大学)
2000-2003 米国イリノイ大学博士研究員
2003-2005 京都大学福井謙一記念研究センター研究員
2003-2006 独立行政法人科学技術振興機構さきがけ研究者
2005-2013 京都大学大学院理学研究科化学専攻准教授
2013-    現職
連絡先
部屋番号 理学部6号館154号室
電話番号 075-753-4006
Fax 番号 075-753-4000
電子メール hayashig + @kuchem.kyoto-u.ac.jp
リンク
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(最終更新日;2015年11月13日)

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