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■京化■京都大学理学部化学科・京都大学大学院理学研究科学専攻
　

三木 邦夫（教授）

専門分野
構造生物学，タンパク質結晶学
研究テーマ
  1. 生体高分子の立体構造に基づく生物学的機能の研究
  2. タンパク質の高次構造形成機能の研究
  3. タンパク質結晶学の方法に関する研究
代表的な論文
  1. Charge-density Analysis of an Iron-sulfur Protein at an Ultra-high Resolution of 0.48 Å
    Y. Hirano, K. Takeda, and K. Miki
    Nature, 508, 534, 281-284 (2016).
  2. Structural Basis of a Ni Acquisition Cycle for [NiFe]-Hydrogenase by HypA and Its Enhancer
    S. Watanabe, T. Kawashima, Y. Nishitani, T. Kanai, T. Wada, K. Inaba, H. Atomi, T. Imanaka, and K. Miki
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 112, 7701-7706 (2015).
  3. Structure of the LH1–RC Complex from Thermochromatium tepidum at 3.0 Å
    S. Niwa, L.-J. Yu, K. Takeda, Y. Hirano, T. Kawakami, Z.-Y. Wang-Otomo, and K. Miki
    Nature, 508, 228-232 (2014).
  4. Crystal Structures of the Carbamoylated and Cyanated Forms of HypE for [NiFe] Hydrogenase Maturation
    T. Tominaga, S. Watanabe, R. Matsumi, H. Atomi, T. Imanaka, and K. Miki
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 110, 20485-20490 (2013).
  5. Substrate Distortion Contributes to the Catalysis of Orotidine 5'-monophosphate Decarboxylase
    M. Fujihashi, T. Ishida, S. Kuroda, L. P. Kotra, E. F. Pai, and K. Miki
    J. Am. Chem. Soc., 135, 17432-17443 (2013).
  6. Non-equivalence Observed for the 16-Meric Structure of a Small Heat Shock Protein, SpHsp16.0 from Schizosaccharomyces pombe
    Y. Hanazono, K. Takeda, T. Oka, T. Abe, T. Tomonari, N. Akiyama, Y. Aikawa, M. Yohda, and K. Miki
    Structure, 21, 220-228 (2013).
  7. Crystal Structures of the HypCD Complex and the HypCDE Ternary Complex: Transient Intermediate Complexes during [NiFe] Hydrogenase Maturation
    S. Watanabe, R. Matsumi, H. Atomi, T. Imanaka, and K. Miki
    Structure, 20, 2124-2137 (2012).
  8. Inter-subunit Interaction and Quaternary Rearrangement Defined by the Central Stalk of Prokaryotic V1-ATPase
    N. Numoto, Y. Hasegawa, K. Takeda, and K. Miki
    EMBO Rep., 10, 1228-1234 (2009).
  9. Crystal Structure of the Conserved N-terminal Domain of the Peroxisomal Matrix-Protein-Import Receptor, Pex14p
    J.-R. Su, K. Takeda, S. Tamura, Y. Fujiki, and K. Miki
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 106, 417-421 (2009).
  10. Structural Basis of Oxidative Stress Sensing and DNA Distortion Mechanisms by a [2Fe-2S] Transcriptional Factor, SoxR
    S. Watanabe, A. Kita, K. Kobayashi, and K. Miki
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 105, 4121-4126 (2008).
  11. Structural Basis for Regulation of Bifunctional Roles in Replication Initiator Protein
    A. Nakamura, C. Wada, and K. Miki
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 104, 18484-18489 (2007).
  12. Crystal Structures of [NiFe] Hydrogenase Maturation Proteins, HypC, HypD and HypE: Insights into Cyanation Reaction by Thiol Redox Signaling
    S. Watanabe, R. Matsumi, T. Arai, H. Atomi, T. Imanaka, and K. Miki
    Mol. Cell, 27, 29-40 (2007).
  13. Structure of an Extracellular Giant Haemoglobin of the Gutless Beard Worm Oligobrachia mashikoi
    N. Numoto, T. Nakagawa, A. Kita, Y. Sasayama, Y. Fukumori, and K. Miki
    Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 102, 14521-14526 (2005).
  14. Crystal Structures of Bacterial Lipoprotein Localization Factors, LolA and LolB
    K. Takeda, H. Miyatake, N. Yokota, S. Matsuyama, H. Tokuda, and K. Miki
    EMBO J., 22, 3199-3209 (2003).
略歴・受賞・役員
1977～1978　 大阪大学大学院工学研究科博士後期課程（D1中退），工学博士 (1981)
1978～1990 大阪大学工学部・助手
1982～1983 マックスプランク生化学研究所（Robert Huber研究室）文部省在外研究員
1990～1994 東京工業大学資源化学研究所・助教授
1994～1995 京都大学理学部化学教室・教授
1995～現在　 京都大学大学院理学研究科化学専攻・教授
1999 東北大学学際科学研究センター・教授（併任）
1999～2002 京都大学大学院理学研究科・付属機器分析センター長
1999～2007 理化学研究所播磨研究所・招聘主任研究員（兼任）
2007～2008 理化学研究所播磨研究所・チームリーダー（兼任）
2008～2016 理化学研究所播磨研究所・客員主管研究員（兼任）
2014～ 理化学研究所・名誉研究員
　　
1987　 日本化学会進歩賞
2001 日本結晶学会学術賞
　　
1998～現在　 Advisory Board (2011〜) / Editorial Board (2010) / Editor (〜2010), Zeitschrift für Kristallographie (Oldenbourg Verlag, Germany)
2000～現在 Editorial Board, PROTEINS: Structure, Function and Bioinformatics (Wiley InterScience, USA)
2005～現在 Co-Editor, Acta Crystallographica, Section D, Biological Crystallography, (International Union of Crystallography, UK)
　 　
1997～2001　 (財) 高輝度光科学研究センター・諮問委員会委員
2001～2003 高エネルギー加速器研究機構・物質構造科学研究所・運営協議員
2003～2006 日本学術会議・結晶学研究連絡委員会委員
2007〜2011 高エネルギー加速器研究機構・物質構造科学研究所，放射光科学研究施設国際諮問委員会委員
2008～2010 高エネルギー加速器研究機構・物質構造科学研究所，Photon Factory 懇談会会長
1997～2002　 日本学術振興会未来開拓研究推進事業・生命科学領域（生体分子の構造と機能調節），プロジェクトリーダー
2002～2007 文部科学省研究振興局タンパク3000プロジェクト推進委員会委員，個別的解析プログラム中核拠点代表者
2013～2018 文部科学省研究振興局光･量子融合連携研究開発プログラム，利用課題責任者
　　
日本結晶学会・会長 (2014〜2016)，評議員 (1995〜2001, 2002〜2008, 2009〜2015, 2016〜2018)，監査役 (2016〜2018)，編集委員長 (1996〜1998)，平成11年度年会実行委員長 (1998〜1999)
日本蛋白質科学会・副会長 (2014〜2016)，理事 (2001〜2006, 2008〜2012)，第6回年会年会長 (2006)
日本生化学会・評議員 (1995〜現在)
日本生物物理学会・委員 (1996〜2000, 2002〜2004, 2005〜2007)，運営委員 (1996〜1998, 2002〜2004)，男女共同参画・若手問題検討委員会委員長 (2003〜2004)
連絡先
部屋番号　理学部６号館456号室
電話番号　075-753-4029，075-753-4063（秘書）
ファクス番号　075-753-4032
電子メール　miki　＋　@kuchem.kyoto-u.ac.jp
リンク
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（最終更新日；2018年04月05日）
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